近日,中国农业科学院郑州果树研究所李杏种质改进团队完成为了代表性杏品种‘金太阳’的高质量基因组破译事情,为该物种主要经济性状改进奠基遗传学基础。相干研究结果5月2日发表在国际知名期刊《科学数据》(Scientific Data)。
金太阳杏的果实。中国农科院郑果所供图 作为蔷薇科李属的主要成员,杏是全世界广泛栽培的温带果树。其果实养分富厚、风韵怪异,鲜食加工两宜,经济价值显著。同时,杏树于水土连结与荒原化防治等方面亦具备主要生态价值。然而,与其他近缘果树物种比拟,杏的基因组研究相对于滞后,限定了性状解析与份子育种进程。
研究团队综合应用多种测序技能,初次实现了良好杏品种‘金太阳’端粒到端粒(T2T)完好口基因组组装。该基因组全长251.36 Mb,各项焦点质控指标体现优良。
该T2T组装乐成解析了全数8个着丝粒区域和14条完备的端粒布局,为基因组布局完备性提供了有力证据。基因组解释成果显示,杏基因组反复序列占比43.38%,共猜测获得25999个卵白编码基因。
与已经报导的‘金太阳’基因组草图比拟,该T2T基因构成功弥补了172个残留缺口,累计补全序列达1.27 Mb,显著晋升了基因组的持续性与完备性。进一步的布局变异阐发显示,与草图比拟,T2T版本中存于易位894个(占基因组1.01%)、倒位51个(占0.42%)以和反复序列106个(占0.07%)。
该研究是郑果地点“李属基因组规划”方面取患上的又一主要进展,获得中国农业科学院所级青年英才培育项目、中国农科院科技立异工程、重庆市人平易近当局与中国农业科学院战略互助项目和河南省科技兴林等项目的资助。
相干论文信息:https://doi.org/10.1038/s41597-026-07371-4
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