近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业微生物组学与养分康健立异团队开发了宏基因组阐发新技能MetaKSSD，显著晋升阐发效率与正确性，助力发明更多微生物联系关系同时实实际时检测。相干研究结果发表于《天然—计较科学》（Nature Computational Science）上。
宏基因组阐发依靠年夜范围标志数据库举行物种鉴定与品貌预计，但面对数据库范围膨胀、更新滞后和处置惩罚效率不足的挑战。传统要领依靠重大的参考数据库，占用存储空间年夜、更新坚苦，且号令行、上传云端存于安全与带宽限定。跟着基因组数据的爆炸式增加，亟需一种轻量化、用户友爱的于线阐发东西。
该研究开发了一种宏基因组阐发新技能——MetaKSSD，该技能经由过程素描运算，可拓展性三木SEO-比拟传统要领晋升了53倍。于现实测试中，MetaKSSD还有展示了显著的速率上风，以约11GB 的样本为例，完成其品貌阐发仅需约11秒。为降低利用门坎，研究还有提供MetaKSSD的客户端—办事器事情模式，用户可于有限带宽情况下实实际时于线阐发。该研究对于在高精度年夜范围宏基因组阐发、宏基因组年夜样本数据搜集和宏基因组年夜模子构建具备庞大意义。
该研究获得广东省试验室专项启动经费、广东省试验室科研使命多组学算法开发等项目的撑持。
相干论文信息：https://doi.org/10.1038/s43588-025-00855-0
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